Вівторок, 8 липня 2014 р. - Колектив дослідників з Інституту Вал д'Еброн Інститут Ресерка (VHIR) взяв участь у міжнародному дослідженні, яке виявило 518 нових мікробактерій, повністю невідомих до цього часу, у мікробіоти людини (кишкової флори).
Дослідження, в рамках якого вчені застосували новий підхід до біоінформатичного аналізу, також розширили каталог відомих мікробних генів з 3 до 10 мільйонів.
Результати цього дослідження, опубліковані в неділю журналом Nature Biotechnology, є частиною європейського проекту MetaHIT (Metagenomics Human Intestinal Tract), наділеного 11, 4 мільйонами євро, щоб дослідити, як мікробіом людини стосується здоров'я та хвороб . Інститут Vall d'Hebron Recerca (VHIR) - один з 13-ти учасників цього проекту - і єдиний іспанський центр - під керівництвом доктора Франциско Гуарнера, який пояснив, що не всі досліджувані зразки мають це кількість невідомих видів.
Зразки кишкової флори деяких особин мають дуже мало цих видів, і при детальному аналізі вони побачили, що вони є зразками хворих на хворобу Крона. "Це говорить про те, що ці види, до цих пір невідомі, можливо, є тими, які роблять різницю між мікробіотою здорових людей та хворою", - заявив Гуарнер.
На думку дослідника, ці дані відкривають стратегії, щоб спробувати відновити цих видів за допомогою харчових втручань: введення волокон, пребіотиків, які допомагають селективному росту деяких видів або пробіотиків.
Ці невідомі бактерії, ймовірно, належать до так званих "хороших бактерій", оскільки вони не є типовими, які викликають інфекцію, а також не відомі або відокремлені раніше. За словами Гуарнера, виявлені бактерії неможливо виділити, оскільки "майже напевно вони не виживуть поза товстої кишки, щоб пересадити її".
Особа, відповідальна за роботу та дослідник групи VHIR з фізіології та травної патофізіології, вказала, що виявлені нові види "не піддаються обробці, дуже чутливі до кисню, тобто є дуже суворими анаеробами і встановлюють велику залежність від свого середовища, щоб мати можливість вижити ». "З тієї ж причини, коли ми зайшли до баз даних, ми не знайшли сліду і до цих пір нічого про них не знали", - сказав Гуарнер.
Відкриття стало можливим завдяки новому підходу до біоінформатичного аналізу, який дозволив цим видам «вийти на поверхню».
"Наразі - за словами Гуарнера -, лише 10% секвенованого генетичного матеріалу відомо з 95% надійністю. Це залишає величезну сіру область, над якою зараз працюють".
Дослідження виявило 741 різного роду метагеномні, названі за неможливість присвоїти їм ім'я. На противагу базам даних, дослідники побачили, що 115 з цих видів були вже відомі, а 518 - невідомі; решта 108 частково відомі.
"Тепер ми знаємо, як виглядає геном цих метагеномічних видів, але не їхні імена та прізвища", - пояснив Гуарнер.
Є невелика кількість, види яких невідомі, але їх стать або сім'я, до якої вони належать, і приблизно 200 метагеномічних видів описаних не можна жодним чином класифікувати, оскільки більше 80% їх генів абсолютно невідомі сьогодні
На думку вчених, мікроорганізмів, які живуть у людини, приблизно в 100 мільярдів, що в 10 разів більше загальної кількості людських клітин.
Початкові результати цього ж проекту в 2010 році вказували на 3 300 000 різних генів, переведених на 20 000 різних функцій, 5000 з яких були поки що абсолютно невідомі.
У кожної людини близько 600 000 цих мікробних генів, а 300 000 постійно повторюються серед усіх людей. "У цьому новому дослідженні число помножено на три і досягнуто 9 879 896 різних генів", - сказав Гуарнер.
Джерело:
Теги:
Здоров'я Новини Сексуальність
Дослідження, в рамках якого вчені застосували новий підхід до біоінформатичного аналізу, також розширили каталог відомих мікробних генів з 3 до 10 мільйонів.
Результати цього дослідження, опубліковані в неділю журналом Nature Biotechnology, є частиною європейського проекту MetaHIT (Metagenomics Human Intestinal Tract), наділеного 11, 4 мільйонами євро, щоб дослідити, як мікробіом людини стосується здоров'я та хвороб . Інститут Vall d'Hebron Recerca (VHIR) - один з 13-ти учасників цього проекту - і єдиний іспанський центр - під керівництвом доктора Франциско Гуарнера, який пояснив, що не всі досліджувані зразки мають це кількість невідомих видів.
Зразки кишкової флори деяких особин мають дуже мало цих видів, і при детальному аналізі вони побачили, що вони є зразками хворих на хворобу Крона. "Це говорить про те, що ці види, до цих пір невідомі, можливо, є тими, які роблять різницю між мікробіотою здорових людей та хворою", - заявив Гуарнер.
"Хороші бактерії"
На думку дослідника, ці дані відкривають стратегії, щоб спробувати відновити цих видів за допомогою харчових втручань: введення волокон, пребіотиків, які допомагають селективному росту деяких видів або пробіотиків.
Ці невідомі бактерії, ймовірно, належать до так званих "хороших бактерій", оскільки вони не є типовими, які викликають інфекцію, а також не відомі або відокремлені раніше. За словами Гуарнера, виявлені бактерії неможливо виділити, оскільки "майже напевно вони не виживуть поза товстої кишки, щоб пересадити її".
Особа, відповідальна за роботу та дослідник групи VHIR з фізіології та травної патофізіології, вказала, що виявлені нові види "не піддаються обробці, дуже чутливі до кисню, тобто є дуже суворими анаеробами і встановлюють велику залежність від свого середовища, щоб мати можливість вижити ». "З тієї ж причини, коли ми зайшли до баз даних, ми не знайшли сліду і до цих пір нічого про них не знали", - сказав Гуарнер.
Різні метагеномічні види
Відкриття стало можливим завдяки новому підходу до біоінформатичного аналізу, який дозволив цим видам «вийти на поверхню».
"Наразі - за словами Гуарнера -, лише 10% секвенованого генетичного матеріалу відомо з 95% надійністю. Це залишає величезну сіру область, над якою зараз працюють".
Дослідження виявило 741 різного роду метагеномні, названі за неможливість присвоїти їм ім'я. На противагу базам даних, дослідники побачили, що 115 з цих видів були вже відомі, а 518 - невідомі; решта 108 частково відомі.
"Тепер ми знаємо, як виглядає геном цих метагеномічних видів, але не їхні імена та прізвища", - пояснив Гуарнер.
Є невелика кількість, види яких невідомі, але їх стать або сім'я, до якої вони належать, і приблизно 200 метагеномічних видів описаних не можна жодним чином класифікувати, оскільки більше 80% їх генів абсолютно невідомі сьогодні
У людини 600 000 мікробних генів
На думку вчених, мікроорганізмів, які живуть у людини, приблизно в 100 мільярдів, що в 10 разів більше загальної кількості людських клітин.
Початкові результати цього ж проекту в 2010 році вказували на 3 300 000 різних генів, переведених на 20 000 різних функцій, 5000 з яких були поки що абсолютно невідомі.
У кожної людини близько 600 000 цих мікробних генів, а 300 000 постійно повторюються серед усіх людей. "У цьому новому дослідженні число помножено на три і досягнуто 9 879 896 різних генів", - сказав Гуарнер.
Джерело:
