Понеділок, 24 червня 2013 р. - Вчені з Австралії та США надають нові знання для розуміння тривимірної структури генома, однієї з найбільших проблем, що стоять перед областю геноміки та генетики, висновки яких опубліковані в її цифровому виданні Природа Генетика ».
Близько трьох метрів ДНК тісно складені в ядрі кожної клітини нашого організму, що дозволяє деяким генам «експресуватися» або активуватися, виключаючи інші. Лікарі Тім Мерсер та Джон Меттік з Інституту медичних досліджень Гарвана в Сіднеї та професор Джон Стаматояннопулос з Вашингтонського університету в Сіетлі проаналізували тривимірну структуру генома з високою роздільною здатністю.
Гени складаються з "екзонів" та "інтронів", перший - послідовності, що кодують і експресують білки, а останній - ділянки некодуючої ДНК у середовищі. Коли гени копіюються або транскрибуються, з ДНК в РНК послідовності інтронів вирізаються або "сплайсифікуються", а решта екзони пов'язані ланцюгом, щоб утворити послідовність, що кодує білок. Залежно від екзонів, які перекошуються, один і той же ген може генерувати різні білки.
Використовуючи велику кількість даних проекту ENCODE, доктор Тім Мерсер та його колеги вивели складку геному, виявивши, що навіть усередині гена виділені екзони легко піддаються впливу. "Уявіть собі довгу і надзвичайно складну лозу, її скручені гілки, на яких є деякі виногради, які можна легко зірвати, приховуючи інших поза їх досяжністю", - він наводить приклад. Мерсер
"У той же час уявіть, що лінивий збирач фруктів просто збирає виноград під рукою, - додає він. - Цей же принцип застосовується і до геному. Спеціальні гени та навіть конкретні екзони ставлять в межах досяжності". У цьому сенсі цей дослідник вказує, що в останні роки вчені почали оцінювати, як складання геному допомагає визначити, як воно виражається та регулюється.
"Це дослідження дає перше вказівку на те, що тривимірна структура геному може впливати на сплайсинг генів. Ми можемо зробити висновок, що геном згортається таким чином, що область промотору, послідовність, яка ініціює транскрипцію гена, є знайдені поруч із екзонами, і всі вони перевезені в машину транскрипції ", - наголошує він.
"Це підтримує новий погляд на речі, що геном згинається навколо механізму транскрипції, а не навпаки. Ті гени, які контактують з механізмом транскрипції, отримують копії, а частини, які орбітують далеко їх ігнорують », - підсумовує цей дослідник.
Джерело:
Теги:
Психологія Препарати Секс
Близько трьох метрів ДНК тісно складені в ядрі кожної клітини нашого організму, що дозволяє деяким генам «експресуватися» або активуватися, виключаючи інші. Лікарі Тім Мерсер та Джон Меттік з Інституту медичних досліджень Гарвана в Сіднеї та професор Джон Стаматояннопулос з Вашингтонського університету в Сіетлі проаналізували тривимірну структуру генома з високою роздільною здатністю.
Гени складаються з "екзонів" та "інтронів", перший - послідовності, що кодують і експресують білки, а останній - ділянки некодуючої ДНК у середовищі. Коли гени копіюються або транскрибуються, з ДНК в РНК послідовності інтронів вирізаються або "сплайсифікуються", а решта екзони пов'язані ланцюгом, щоб утворити послідовність, що кодує білок. Залежно від екзонів, які перекошуються, один і той же ген може генерувати різні білки.
Використовуючи велику кількість даних проекту ENCODE, доктор Тім Мерсер та його колеги вивели складку геному, виявивши, що навіть усередині гена виділені екзони легко піддаються впливу. "Уявіть собі довгу і надзвичайно складну лозу, її скручені гілки, на яких є деякі виногради, які можна легко зірвати, приховуючи інших поза їх досяжністю", - він наводить приклад. Мерсер
"У той же час уявіть, що лінивий збирач фруктів просто збирає виноград під рукою, - додає він. - Цей же принцип застосовується і до геному. Спеціальні гени та навіть конкретні екзони ставлять в межах досяжності". У цьому сенсі цей дослідник вказує, що в останні роки вчені почали оцінювати, як складання геному допомагає визначити, як воно виражається та регулюється.
"Це дослідження дає перше вказівку на те, що тривимірна структура геному може впливати на сплайсинг генів. Ми можемо зробити висновок, що геном згортається таким чином, що область промотору, послідовність, яка ініціює транскрипцію гена, є знайдені поруч із екзонами, і всі вони перевезені в машину транскрипції ", - наголошує він.
"Це підтримує новий погляд на речі, що геном згинається навколо механізму транскрипції, а не навпаки. Ті гени, які контактують з механізмом транскрипції, отримують копії, а частини, які орбітують далеко їх ігнорують », - підсумовує цей дослідник.
Джерело:
